Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS5

GABBR1, Gamma-aminobutyric acid type B receptor subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABBR1Q9UBS5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
GABBR1Q9UBS5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
GABBR1Q9UBS5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
GABBR1Q9UBS5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms