Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
PPARGC1AQ9UBK2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PPARGC1AQ9UBK2 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.59
PPARGC1AQ9UBK2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PPARGC1AQ9UBK2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms