Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2M1

LRP2BP, LRP2-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP2BPQ9P2M1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
LRP2BPQ9P2M1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC29.32■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
LRP2BPQ9P2M1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
LRP2BPQ9P2M1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
LRP2BPQ9P2M1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms