Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2F8

SIPA1L2, Signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1L2Q9P2F8 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
SIPA1L2Q9P2F8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.32■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
SIPA1L2Q9P2F8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.2■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
SIPA1L2Q9P2F8 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
SIPA1L2Q9P2F8 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.11■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC34.11■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC34.1■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
SIPA1L2Q9P2F8 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms