Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0T7

TMEM9, Transmembrane protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM9Q9P0T7 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TMEM9Q9P0T7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TMEM9Q9P0T7 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMEM9Q9P0T7 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms