Protein–RNA interactions for Protein: Q9P031

CCDC59, Thyroid transcription factor 1-associated protein 26, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC59Q9P031 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC59Q9P031 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC59Q9P031 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.33■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CCDC59Q9P031 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms