Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM4

BICRA, BRD4-interacting chromatin-remodeling complex-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BICRAQ9NZM4 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC46.33■■■■■ 5.01
BICRAQ9NZM4 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
BICRAQ9NZM4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
BICRAQ9NZM4 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
BICRAQ9NZM4 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC46.31■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC46.31■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC46.3■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC46.3■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC46.3■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.29■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC46.29■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC46.28■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC46.28■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC46.27■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC46.26■■■■■ 5
BICRAQ9NZM4 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC46.23■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC46.23■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC46.22■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC46.22■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.22■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC46.2■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC46.2■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.99
BICRAQ9NZM4 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC46.19■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC46.17■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.17■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.15■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC46.15■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC46.14■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.98
BICRAQ9NZM4 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC46.13■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC46.13■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC46.12■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.11■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC46.1■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.08■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC46.08■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC46.08■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC46.07■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.07■■■■■ 4.97
BICRAQ9NZM4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.06■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC46.05■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC46.04■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.04■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC46.03■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC46.03■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC46.03■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC46.03■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC46.01■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC46.01■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC46.01■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.01■■■■■ 4.96
BICRAQ9NZM4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
BICRAQ9NZM4 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC46■■■■■ 4.95
BICRAQ9NZM4 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC45.99■■■■■ 4.95
BICRAQ9NZM4 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.99■■■■■ 4.95
BICRAQ9NZM4 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.98■■■■■ 4.95
BICRAQ9NZM4 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC45.97■■■■■ 4.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms