Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ94

NLGN3, Neuroligin-3, humanhuman

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN3Q9NZ94 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
NLGN3Q9NZ94 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
NLGN3Q9NZ94 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
NLGN3Q9NZ94 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms