Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUM4

TMEM106B, Transmembrane protein 106B, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TMEM106BQ9NUM4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
TMEM106BQ9NUM4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
TMEM106BQ9NUM4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms