Protein–RNA interactions for Protein: Q9NU53

GINM1, Glycoprotein integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GINM1Q9NU53 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GINM1Q9NU53 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC28.4■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
GINM1Q9NU53 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
GINM1Q9NU53 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
GINM1Q9NU53 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms