Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTK1

DEPP, Protein DEPP, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPPQ9NTK1 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
DEPPQ9NTK1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
DEPPQ9NTK1 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
DEPPQ9NTK1 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms