Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTG1

PKDREJ, Polycystic kidney disease and receptor for egg jelly-related protein, humanhuman

Predictions only

Length 2,253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKDREJQ9NTG1 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PKDREJQ9NTG1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.99
PKDREJQ9NTG1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PKDREJQ9NTG1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms