Protein–RNA interactions for Protein: Q9NS71

GKN1, Gastrokine-1, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GKN1Q9NS71 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GKN1Q9NS71 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
GKN1Q9NS71 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GKN1Q9NS71 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
GKN1Q9NS71 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms