Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR77

PXMP2, Peroxisomal membrane protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PXMP2Q9NR77 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PXMP2Q9NR77 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC27.58■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.57■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.52■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.51■■■□□ 2
PXMP2Q9NR77 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PXMP2Q9NR77 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PXMP2Q9NR77 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.7 ms