Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW8

CNGB3, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-3, humanhuman

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Length 809 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB3Q9NQW8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNGB3Q9NQW8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CNGB3Q9NQW8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CNGB3Q9NQW8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
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