Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP74

PALMD, Palmdelphin, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALMDQ9NP74 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
PALMDQ9NP74 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PALMDQ9NP74 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PALMDQ9NP74 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms