Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9T3

ELP3, Elongator complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELP3Q9H9T3 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ELP3Q9H9T3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ELP3Q9H9T3 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
ELP3Q9H9T3 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ELP3Q9H9T3 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ELP3Q9H9T3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms