Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E3

COG4, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG4Q9H9E3 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
COG4Q9H9E3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
COG4Q9H9E3 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
COG4Q9H9E3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
COG4Q9H9E3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms