Protein–RNA interactions for Protein: Q9H5V8

CDCP1, CUB domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCP1Q9H5V8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CDCP1Q9H5V8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CDCP1Q9H5V8 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CDCP1Q9H5V8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms