Protein–RNA interactions for Protein: Q9H094

NBPF3, Neuroblastoma breakpoint family member 3, humanhuman

Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF3Q9H094 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
NBPF3Q9H094 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NBPF3Q9H094 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
NBPF3Q9H094 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.19
NBPF3Q9H094 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NBPF3Q9H094 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.6 ms