Protein–RNA interactions for Protein: Q9C086

INO80B, INO80 complex subunit B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80BQ9C086 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
INO80BQ9C086 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
INO80BQ9C086 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
INO80BQ9C086 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
INO80BQ9C086 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms