Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
FOXQ1Q9C009 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
FOXQ1Q9C009 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FOXQ1Q9C009 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
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