Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV2

TRIM54, Tripartite motif-containing protein 54, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM54Q9BYV2 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRIM54Q9BYV2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRIM54Q9BYV2 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TRIM54Q9BYV2 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM54Q9BYV2 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TRIM54Q9BYV2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.7 ms