Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYG5

PARD6B, Partitioning defective 6 homolog beta, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PARD6BQ9BYG5 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PARD6BQ9BYG5 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PARD6BQ9BYG5 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
PARD6BQ9BYG5 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
PARD6BQ9BYG5 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.7 ms