Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU61

NDUFAF3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF3Q9BU61 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NDUFAF3Q9BU61 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
NDUFAF3Q9BU61 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
NDUFAF3Q9BU61 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.4 ms