Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU40

CHRDL1, Chordin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRDL1Q9BU40 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRDL1Q9BU40 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRDL1Q9BU40 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRDL1Q9BU40 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRDL1Q9BU40 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
CHRDL1Q9BU40 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
CHRDL1Q9BU40 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
CHRDL1Q9BU40 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms