Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQK8

LPIN3, Phosphatidate phosphatase LPIN3, humanhuman

Predictions only

Length 851 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LPIN3Q9BQK8 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
LPIN3Q9BQK8 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
LPIN3Q9BQK8 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LPIN3Q9BQK8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LPIN3Q9BQK8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms