Protein–RNA interactions for Protein: Q99575

POP1, Ribonucleases P/MRP protein subunit POP1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POP1Q99575 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
POP1Q99575 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POP1Q99575 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POP1Q99575 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
POP1Q99575 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
POP1Q99575 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POP1Q99575 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
POP1Q99575 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
POP1Q99575 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
POP1Q99575 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POP1Q99575 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
POP1Q99575 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
POP1Q99575 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
POP1Q99575 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POP1Q99575 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POP1Q99575 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POP1Q99575 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POP1Q99575 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
POP1Q99575 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POP1Q99575 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
POP1Q99575 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POP1Q99575 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
POP1Q99575 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
POP1Q99575 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POP1Q99575 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POP1Q99575 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
POP1Q99575 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
POP1Q99575 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
POP1Q99575 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
POP1Q99575 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
POP1Q99575 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POP1Q99575 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
POP1Q99575 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POP1Q99575 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
POP1Q99575 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
POP1Q99575 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POP1Q99575 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POP1Q99575 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POP1Q99575 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
POP1Q99575 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
POP1Q99575 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
POP1Q99575 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POP1Q99575 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POP1Q99575 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POP1Q99575 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POP1Q99575 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
POP1Q99575 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
POP1Q99575 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms