Protein–RNA interactions for Protein: Q99569

PKP4, Plakophilin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP4Q99569 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP4Q99569 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PKP4Q99569 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PKP4Q99569 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PKP4Q99569 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PKP4Q99569 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms