Protein–RNA interactions for Protein: Q99453

PHOX2B, Paired mesoderm homeobox protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHOX2BQ99453 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PHOX2BQ99453 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PHOX2BQ99453 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PHOX2BQ99453 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHOX2BQ99453 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.5 ms