Protein–RNA interactions for Protein: Q96SB4

SRPK1, SRSF protein kinase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRPK1Q96SB4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SRPK1Q96SB4 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SRPK1Q96SB4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SRPK1Q96SB4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SRPK1Q96SB4 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms