Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
CCNL2Q96S94 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CCNL2Q96S94 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CCNL2Q96S94 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms