Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ3

MCCC1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 725 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCCC1Q96RQ3 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCCC1Q96RQ3 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
MCCC1Q96RQ3 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCCC1Q96RQ3 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms