Protein–RNA interactions for Protein: Q96PD5

PGLYRP2, N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGLYRP2Q96PD5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PGLYRP2Q96PD5 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGLYRP2Q96PD5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PGLYRP2Q96PD5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms