Protein–RNA interactions for Protein: Q96NY7

CLIC6, Chloride intracellular channel protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 704 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC6Q96NY7 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
CLIC6Q96NY7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
CLIC6Q96NY7 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.36■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CLIC6Q96NY7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CLIC6Q96NY7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.9 ms