Protein–RNA interactions for Protein: Q96MS0

ROBO3, Roundabout homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,386 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROBO3Q96MS0 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROBO3Q96MS0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROBO3Q96MS0 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROBO3Q96MS0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROBO3Q96MS0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ROBO3Q96MS0 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
ROBO3Q96MS0 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
ROBO3Q96MS0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
ROBO3Q96MS0 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ROBO3Q96MS0 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
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