Protein–RNA interactions for Protein: Q96MP5

ZSWIM3, Zinc finger SWIM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZSWIM3Q96MP5 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZSWIM3Q96MP5 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
ZSWIM3Q96MP5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZSWIM3Q96MP5 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZSWIM3Q96MP5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZSWIM3Q96MP5 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZSWIM3Q96MP5 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms