Protein–RNA interactions for Protein: Q96MG7

NSMCE3, Non-structural maintenance of chromosomes element 3 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSMCE3Q96MG7 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
NSMCE3Q96MG7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
NSMCE3Q96MG7 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NSMCE3Q96MG7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms