Protein–RNA interactions for Protein: Q96LY2

CCDC74B, Coiled-coil domain-containing protein 74B, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC74BQ96LY2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC74BQ96LY2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CCDC74BQ96LY2 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
CCDC74BQ96LY2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms