Protein–RNA interactions for Protein: Q96L92

SNX27, Sorting nexin-27, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX27Q96L92 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SNX27Q96L92 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SNX27Q96L92 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SNX27Q96L92 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SNX27Q96L92 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 166.7 ms