Protein–RNA interactions for Protein: Q96I34

PPP1R16A, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 16A, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1R16AQ96I34 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PPP1R16AQ96I34 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PPP1R16AQ96I34 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PPP1R16AQ96I34 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms