Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SIPA1Q96FS4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SIPA1Q96FS4 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SIPA1Q96FS4 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms