Protein–RNA interactions for Protein: Q96EF6

FBXO17, F-box only protein 17, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO17Q96EF6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
FBXO17Q96EF6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.31■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC21.28■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.27■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
FBXO17Q96EF6 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
FBXO17Q96EF6 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms