Protein–RNA interactions for Protein: Q96DB5

RMDN1, Regulator of microtubule dynamics protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RMDN1Q96DB5 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RMDN1Q96DB5 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
RMDN1Q96DB5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
RMDN1Q96DB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
RMDN1Q96DB5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms