Protein–RNA interactions for Protein: Q96CB9

NSUN4, 5-methylcytosine rRNA methyltransferase NSUN4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSUN4Q96CB9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC29.23■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
NSUN4Q96CB9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NSUN4Q96CB9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NSUN4Q96CB9 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NSUN4Q96CB9 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.6 ms