Protein–RNA interactions for Protein: Q96AH8

RAB7B, Ras-related protein Rab-7b, humanhuman

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB7BQ96AH8 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RAB7BQ96AH8 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RAB7BQ96AH8 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RAB7BQ96AH8 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms