Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC34.51■■■■□ 3.12
PTPRUQ92729 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
PTPRUQ92729 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
PTPRUQ92729 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.09
PTPRUQ92729 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC34.29■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
PTPRUQ92729 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms