Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PHF3Q92576 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
PHF3Q92576 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PHF3Q92576 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms