Protein–RNA interactions for Protein: Q92530

PSMF1, Proteasome inhibitor PI31 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMF1Q92530 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PSMF1Q92530 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PSMF1Q92530 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PSMF1Q92530 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.6 ms