Protein–RNA interactions for Protein: Q8WY07

SLC7A3, Cationic amino acid transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A3Q8WY07 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC7A3Q8WY07 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC7A3Q8WY07 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC7A3Q8WY07 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC7A3Q8WY07 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC7A3Q8WY07 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC7A3Q8WY07 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC7A3Q8WY07 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC7A3Q8WY07 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC7A3Q8WY07 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms